(一)醫務指導委員會(Medical Advisory Committee)
提供醫療及倫理、捐髓者招募、、法律、衛生政策及公眾事務等領域之專業意見
(二)指導委員會(HLA Expert Review Panel)
提供骨髓及幹細胞移植、免疫基因研究發展、配對法則等領域之專業意見
(三)免疫基因實驗室
1.受理檢驗臍帶血庫檢體、驗血活動或各移植中心送回之血樣抗原檢原(ClassⅠ/ClassⅡ)
2.血樣標本之儲存管理
3.實驗結果分析、鑑定及建檔
4.回覆配型報告予資料庫暨行政組
5.各項儀器設備、耗材之維護管理
6.研究發展檢驗科技及基因治療之專業
(四)臍帶血庫
1.受理臍帶血之捐贈
2.臍帶血之管理儲存
3.臍帶血及幹細胞之培養、擴增
4.臍帶血實驗數據與檢驗報告之建檔維護
5.回覆配型報告予資料庫暨行政組
6.儀器設備之維護管理、試劑耗材採購、清點、備製及報銷
(五)臨床醫學暨研究組
1.骨髓及幹細胞移植作業及品質制度之策進
2.骨髓及幹細胞臨床應用之開發及研究
3.醫療及研究專業人才之培育
(六)捐贈活動暨關懷組
1.受贈病患之關懷
2.骨髓捐贈之驗血活動及臍帶血之勸募
3.志工之培訓及招募
4.捐贈者之關懷
5.協助送髓至相關醫療機構
(七)資料庫暨行政組
1.協助捐贈活動之行政事宜
2.骨髓及臍帶血捐贈資料庫之建立
3.受理申請配對作業
4.推動國內外醫療暨研究機構之合作事宜
5.協助其他相關各組之行政事宜
6.企劃及推動中心各種業務
7.協助中心主任及醫務主任各種對外及慈濟各志業體間業務溝通、協調
特別介紹：骨髓捐贈關懷小組
1994年由慈濟委員、慈誠或捐髓者組成的「慈濟骨髓捐贈關懷小組」，成立至今已經13年，全省成員約八百多人。他們除了定期舉辦驗血活動、勸募捐髓者、關懷捐髓者，維持骨髓資料庫的成長外，關懷層面亦擴展到需要協助的血液疾病患者及其家庭。「慈濟骨髓捐贈關懷小組」是募集二十八萬多筆捐髓資料、給了一千多位血液疾病患者家庭希望、讓台灣成為國際聞名的「慈善之島」美稱的幕後英雄。
慈濟骨髓捐贈活動暨關懷組總幹事陳乃裕表示，從早年一年十幾例至目前一年近兩百例的骨髓捐贈，再加上臍帶血的收集、病患的關懷，小組的責任更為加重；因此，組織人力的擴增和培養及整體的設想規畫上，是小組未來努力的目標。
陳乃裕表示，關懷小組志工在過去曾歷經捐者健檢後改變主意不願捐髓，或半途因家人反對而喊停，或送髓至國外時因颱風，飛機抵達目的地上空又折返的情況……，種種變數、層層關卡，在在考驗著關懷小組志工的毅力和能耐。「勸捐、完成骨髓配對雖然辛苦，但成果卻也圓滿！」
(資料更新：2006年6月)
| 
